Forschungsprojekt Autocast

Automated Cancer Screening Based on Real-Time PCR

Gebärmutterhalskrebs, dessen Entstehung oft durch eine Infektion mit dem Humanen Papilloma Virus (HPV) ausgelöst wird, ist die derzeit zweithäufigste Krebserkrankung bei Frauen auf der Welt.
Ziel des Forschungsprojektes AutoCast ist die Entwicklung eines Verfahrens zur Detektion verschiedener Subtypen des HP-Virus in einer Patientenprobe. Der Nachweis des Subtyps wird dabei voll automatisiert mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR) und simultaner Microarray-Analyse in einer geschlossenen Einwegkartusche realisiert. Nachdem der Anwender die Kartusche in das Analysegerät eingelegt hat, soll vom Gerät die PCR und eine Datenauswertung mittels totaler innerer Reflexionsfluoreszenz (TIRF) in Echtzeit vorgenommen werden. Das Volumen einer Probe soll dabei 10 µl nicht überschreiten, um den Bedarf an Probenmaterial sowie Reagenzien so weit wie möglich reduzieren zu können.
Unter Verwendung eines standardisierten Microarrays soll es darüber hinaus möglich sein, die Detektionstechnik an eine Vielzahl verschiedener nukleinsäurebasierter Tests anzupassen. Die Kombination aus Analysegerät, Einwegkartusche und Nachweisreaktion ist hochgradig flexibel und ermöglicht so vielseitige Anwendungen zur Detektion von Pathogenen oder anderen Biomarker Panels. 
In dem von der EU geförderten Projekt arbeiten vier Forschungsinstitute und drei Unternehmen eng zusammen, so dass von der Entwicklung des nukleinsäurebasierten Nachweis bis hin zur Herstellung der Einwegkartusche und des Gerätes in allen Bereichen Kompetenz und Erfahrung zur Verfügung gestellt werden kann.

Fördergeber: EU

Fördernummer: 201525

Laufzeit: 01.08.2008 - 31.07.2011

Unsere Forschungspartner im Projekt AutoCast sind:
Austrian Institute of Technology AIT
BioFluidiX BFX
GenoID GID
Fraunhofer Institut                        
BioChip-Reader
Jenoptik Polymer Systems JOPS
Trinity College Dublin TCD

Ihr Ansprechpartner:
 
Bernd Faltin
Projektleiter Autocast
+49 761 203-73227
+49 761 203-73299
bernd.faltin@imtek.uni-freiburg.de
Standardisiertes Microarray
Veranschaulichung des Ergebnisses einer real-time multi-locus Analyse, basierend auf dem darüber dargestellten standardisierten Microarray. Die gezeigten Messwerte beziehen sich auf den umrandeten Bereich des Arrays